MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 52970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_015387	GCG	2	6	257151	257156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949799
6003	NC_015387	CGG	2	6	257158	257163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949799
6004	NC_015387	GGT	2	6	257182	257187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949799
6005	NC_015387	GGT	2	6	257200	257205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949799
6006	NC_015387	TGC	2	6	257214	257219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949799
6007	NC_015387	GGCAAG	2	12	257225	257236	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	328949799
6008	NC_015387	GGT	2	6	257239	257244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949799
6009	NC_015387	CCG	2	6	257275	257280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949799
6010	NC_015387	AAG	2	6	257282	257287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949799
6011	NC_015387	A	6	6	257354	257359	100 %	0 %	0 %	0 %	328949800
6012	NC_015387	GAA	2	6	257374	257379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949800
6013	NC_015387	CGTG	2	8	257434	257441	0 %	25 %	50 %	25 %	328949800
6014	NC_015387	TGG	2	6	257529	257534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949800
6015	NC_015387	GTG	2	6	257540	257545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949800
6016	NC_015387	ACGTGC	2	12	257577	257588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328949800
6017	NC_015387	CGC	2	6	257650	257655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949801
6018	NC_015387	TTC	2	6	257684	257689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949801
6019	NC_015387	GGC	2	6	257711	257716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949801
6020	NC_015387	CGG	2	6	257722	257727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949801
6021	NC_015387	CGG	2	6	257731	257736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949801
6022	NC_015387	GCG	2	6	257739	257744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949801
6023	NC_015387	GC	3	6	257758	257763	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
6024	NC_015387	ACG	2	6	257769	257774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949801
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6026	NC_015387	TCA	2	6	257871	257876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949801
6027	NC_015387	ACG	2	6	257904	257909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949801
6028	NC_015387	CTC	2	6	257924	257929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949801
6029	NC_015387	TCG	2	6	257937	257942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949801
6030	NC_015387	CG	3	6	257965	257970	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
6031	NC_015387	GGC	2	6	257981	257986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949801
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6035	NC_015387	CG	4	8	258155	258162	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
6036	NC_015387	CCT	2	6	258174	258179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949801
6037	NC_015387	CAC	2	6	258187	258192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949801
6038	NC_015387	C	6	6	258198	258203	0 %	0 %	0 %	100 %	328949801
6039	NC_015387	CGC	2	6	258346	258351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949801
6040	NC_015387	GAG	2	6	258389	258394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949801
6041	NC_015387	TCG	2	6	258435	258440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949801
6042	NC_015387	CAA	2	6	258445	258450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949801
6043	NC_015387	GATC	2	8	258451	258458	25 %	25 %	25 %	25 %	328949801
6044	NC_015387	CG	3	6	258499	258504	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
6045	NC_015387	CG	3	6	258537	258542	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
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6049	NC_015387	GGA	2	6	258664	258669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949801
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6051	NC_015387	GC	3	6	258769	258774	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
6052	NC_015387	GC	3	6	258808	258813	0 %	0 %	50 %	50 %	328949801
6053	NC_015387	G	6	6	258833	258838	0 %	0 %	100 %	0 %	328949801
6054	NC_015387	TTCGAG	2	12	258839	258850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	328949801
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6056	NC_015387	CGGCC	2	10	258981	258990	0 %	0 %	40 %	60 %	328949802
6057	NC_015387	CGA	2	6	259047	259052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949802
6058	NC_015387	CG	3	6	259070	259075	0 %	0 %	50 %	50 %	328949802
6059	NC_015387	GCG	2	6	259126	259131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949802
6060	NC_015387	CTT	2	6	259162	259167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949802
6061	NC_015387	CGTCG	2	10	259195	259204	0 %	20 %	40 %	40 %	328949802
6062	NC_015387	GGAA	2	8	259206	259213	50 %	0 %	50 %	0 %	328949802
6063	NC_015387	CTA	2	6	259236	259241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949802
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6065	NC_015387	GCC	2	6	259254	259259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949802
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6068	NC_015387	GTG	2	6	259307	259312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949802
6069	NC_015387	GCC	2	6	259566	259571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949803
6070	NC_015387	CTG	2	6	259572	259577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949803
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6074	NC_015387	CGC	2	6	259624	259629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949803
6075	NC_015387	ACG	2	6	259636	259641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949803
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6077	NC_015387	CG	3	6	259679	259684	0 %	0 %	50 %	50 %	328949803
6078	NC_015387	GACG	2	8	259709	259716	25 %	0 %	50 %	25 %	328949803
6079	NC_015387	GAGC	2	8	259802	259809	25 %	0 %	50 %	25 %	328949803
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6085	NC_015387	CTGGT	2	10	260014	260023	0 %	40 %	40 %	20 %	328949804
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6088	NC_015387	GCG	2	6	260154	260159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949804
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6091	NC_015387	GC	4	8	260299	260306	0 %	0 %	50 %	50 %	328949804
6092	NC_015387	GCCC	2	8	260409	260416	0 %	0 %	25 %	75 %	328949804
6093	NC_015387	ACC	2	6	260474	260479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949804
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6096	NC_015387	CAG	2	6	260629	260634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949804
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6104	NC_015387	ATC	2	6	261130	261135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949805
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6107	NC_015387	T	6	6	261219	261224	0 %	100 %	0 %	0 %	328949805
6108	NC_015387	C	6	6	261248	261253	0 %	0 %	0 %	100 %	328949805
6109	NC_015387	GC	3	6	261270	261275	0 %	0 %	50 %	50 %	328949805
6110	NC_015387	GAG	2	6	261292	261297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949805
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6114	NC_015387	CG	3	6	261518	261523	0 %	0 %	50 %	50 %	328949806
6115	NC_015387	TGGA	2	8	261558	261565	25 %	25 %	50 %	0 %	328949806
6116	NC_015387	TCG	2	6	261586	261591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949806
6117	NC_015387	ACGC	2	8	261610	261617	25 %	0 %	25 %	50 %	328949806
6118	NC_015387	CCT	2	6	261683	261688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949806
6119	NC_015387	GAC	2	6	261696	261701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949806
6120	NC_015387	GCACCT	2	12	261761	261772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328949806
6121	NC_015387	GCTG	2	8	261816	261823	0 %	25 %	50 %	25 %	328949807
6122	NC_015387	CTCACG	2	12	261829	261840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328949807
6123	NC_015387	GAAC	2	8	261858	261865	50 %	0 %	25 %	25 %	328949807
6124	NC_015387	CTCG	2	8	261918	261925	0 %	25 %	25 %	50 %	328949807
6125	NC_015387	TCC	2	6	261932	261937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
6126	NC_015387	CGG	2	6	261939	261944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949807
6127	NC_015387	CCT	2	6	261972	261977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
6128	NC_015387	CCT	3	9	261999	262007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
6129	NC_015387	CCT	2	6	262014	262019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
6130	NC_015387	TCC	2	6	262025	262030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
6131	NC_015387	CCT	2	6	262065	262070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949807
6132	NC_015387	CCG	2	6	262071	262076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949807
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6134	NC_015387	CGCTG	2	10	262149	262158	0 %	20 %	40 %	40 %	328949807
6135	NC_015387	TGGG	2	8	262162	262169	0 %	25 %	75 %	0 %	328949807
6136	NC_015387	TGT	2	6	262196	262201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949807
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6141	NC_015387	GCG	2	6	262424	262429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949807
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6144	NC_015387	TGG	3	9	262577	262585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949807
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6146	NC_015387	GCAC	2	8	262630	262637	25 %	0 %	25 %	50 %	328949807
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6152	NC_015387	CTG	2	6	262819	262824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949807
6153	NC_015387	GCG	2	6	262883	262888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949807
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6184	NC_015387	CCGG	2	8	264296	264303	0 %	0 %	50 %	50 %	328949808
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6232	NC_015387	GGC	2	6	266072	266077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949809
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6242	NC_015387	CA	3	6	266610	266615	50 %	0 %	0 %	50 %	328949810
6243	NC_015387	G	6	6	266687	266692	0 %	0 %	100 %	0 %	328949810
6244	NC_015387	CAC	2	6	266758	266763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949810
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6365	NC_015387	GGA	2	6	272723	272728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949815
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6492	NC_015387	CGT	2	6	283833	283838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949824
6493	NC_015387	GGA	2	6	283845	283850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949824
6494	NC_015387	CG	3	6	283860	283865	0 %	0 %	50 %	50 %	328949824
6495	NC_015387	GCG	2	6	284002	284007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949824
6496	NC_015387	CAC	2	6	284062	284067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949824
6497	NC_015387	CGCC	2	8	284076	284083	0 %	0 %	25 %	75 %	328949824
6498	NC_015387	CG	3	6	284093	284098	0 %	0 %	50 %	50 %	328949824
6499	NC_015387	GCGA	2	8	284104	284111	25 %	0 %	50 %	25 %	328949824
6500	NC_015387	CGT	3	9	284136	284144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949824

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